In Civilization 4 wird es 18 Nationen geben. Statt wie bisher üblich wird jede Nation nicht nur ein mögliches Oberhaupt besitzen, sondern einige Nationen besitzen 2. So wird es für Deutschland die Oberhäupter Frederick und Bismarck geben. Wie auch schon in Civilization 3 wird jede Nation über eine einzigartige Einheit verfügen. Jedes Oberhaupt verfügt über 2 Charaktereigenschaften. Bei Bismarck sind dies zum Beispiel expansionistisch und industriell. Jede Charaktereigenschaft bringt Boni mit sich und verbilligt bestimmte Gebäude.
| Zivilisation | Oberhaupt 1 | Oberhaupt 2 |
| Ägypten | Hatshepsut | |
| Amerika | George Washington | Franklin D. Roosevelt |
| Arabien | Saladin | |
| Azteken | Montezuma | |
| China | Mao Zedong | Qin Shi Huang |
| Deutschland | Frederick | Bismarck |
| England | Queen Victoria | Queen Elizabeth |
| Frankreich | Louis XIV | Napoleon |
| Griechenland | Alexander | |
| Indien | Mahatma Gandhi | Asoka |
| Inka | Huayna Capac | |
| Japan | Tokugawa | |
| Mali | Mansa Musa | |
| Mongolei | Dschingis Khan | Kublai Khan |
| Persien | Cyrus | |
| Rom | Julius Caesar | |
| Russland | Katharina | Peter |
| Spanien | Königin Isabella |


